初出・単行本収録リスト
光文社の少年漫画雑誌「少年」に掲載された忍者ハットリくんの初出リストと単行本収録表です。藤子不二雄Ⓐランド（ブッキング）は藤子不二雄ランド版と収録内容と巻数が同じであるため省略しています。S＝SUNDAY COMICS（秋田書店）、て＝てんとう虫コミックス（小学館）、ラ＝藤子不二雄ランド（中央公論社）、文＝中公文庫コミック版（中央公論社）、光＝光文社文庫「少年」傑作集（光文社）、数字は収録巻。【例】て3 →てんとう虫コミックス3巻に収録。
忍者ハットリくん【光文社・少年】
| # | 掲載号 | サブタイトル ※掲載時タイトル | S | て | ラ | 文 | 光 |
| 1 | 昭和39年11月号 | ちょっとしつれいつかまつるの巻 | 1 | 1 | 1 | 1 | 5 |
| 2 | 昭和39年12月号 | おのれ！にっくき先生めの巻 | 1 | 1 | 1 | 1 | - |
| 3 | 昭和40年お正月増刊号 | アルバイトの道はきびしゅうござるの巻 | 1 | 1 | 1 | 1 | - |
| 4 | 昭和40年1月号 | 正月のお客もいろいろござるなの巻 | 1 | 1 | 1 | 1 | 5 |
| 5 | 昭和40年2月号 | 毛むくじゃらのお友だちの巻 | 3 | 3 | 1 | 1 | 5 |
| 6 | 昭和40年3月号 | みたかしったか！！ハットリ打法の巻 | 1 | 1 | 1 | 1 | - |
| 7 | 昭和40年4月号 | 先生城へ忍び込みの巻 | 2 | 2 | 1 | 1 | - |
| 8 | 昭和40年5月号 | ケン一氏の一日パパの巻 | 1 | 2 | 1 | 1 | - |
| 9 | 昭和40年6月号 | 甲賀からきた転校生の巻 | 1 | 1 | 1 | 1 | - |
| 10 | 昭和40年7月号 | 兄上！おれが助太刀するぜ！の巻 | 1 | 1 | 1 | 1 | - |
| 11 | 昭和40年8月号 | 秘密ドロボー部員◯・D・8（マル・デー・パー）号の巻 | 2 | 3 | 1 | 1 | 5 |
| 12 | 昭和40年夏休み大増刊号 | ターザンまんが家アイヤイヤの巻 | 3 | 3 | 2 | 1 | - |
| 13 | 昭和40年9月号 | シンゾウお使いに行くの巻 | 2 | 2 | 2 | 1 | - |
| 14 | 昭和40年10月号 | ライフル魔！かくごせいの巻 | 1 | 2 | 2 | 1 | - |
| 15 | 昭和40年11月号 | 8ミリ映画はけんかのもとよの巻 | 2 | 3 | 2 | 1 | 5 |
| 16 | 昭和40年12月号 | 早がけ術もひかり号にはかなわぬでござるの巻 | 1 | 2 | 2 | 1 | - |
| 17 | 昭和41年1月号 | 自由を求めて家出修業の巻 | 3 | 3 | 2 | 1 | 5 |
| 18 | 昭和41年2月号 | ムササビの術で空高くの巻 | 1 | 2 | 2 | 1 | - |
| 19 | 昭和41年3月号 | ロボット忍者ロボ丸でござるの巻 | 3 | 8 | 2 | 1 | - |
| 20 | 昭和41年4月号 | ハットリくん七変化の巻 | 2 | 1 | 2 | 1 | 5 |
| 21 | 昭和41年5月号 | 忍者旅館も下忍にツメタイの巻 | 1 | 1 | 2 | 1 | - |
| 22 | 昭和41年6月号 | ハットリ課長はそろばん二刀流の巻 ※サラリーマン・ハットリくんの巻 | 1 | 2 | 2 | 1 | 5 |
| 23 | 昭和41年7月号 | ハットリくん学校へ行くの巻 | 3 | - | 3 | 2 | - |
| 24 | 昭和41年8月号 | ハットリくん対ナポレオン・ボンドの巻 | 2 | 2 | 3 | 2 | - |
| 25 | 昭和41年9月号 | 無人島漂流の巻 | 3 | 4 | 3 | 2 | - |
| 26 | 昭和41年10月号 | 忍法「小判ほり」の巻 | 1 | 2 | 3 | 2 | 5 |
| 27 | 昭和41年11月号 | ガンマニアはごめんでござるの巻 | 2 | - | 3 | 2 | 5 |
| 28 | 昭和41年12月号 | 三匹の忍者の巻 | 2 | 3 | 3 | 2 | - |
| 29 | 昭和42年1月号 | 父上、母上おなつかしゅうござるの巻 | 2 | 3 | 3 | 2 | - |
| 30 | 昭和42年2月号 | 住宅難には忍者もマイッタの巻 | 2 | 3 | 3 | 2 | - |
| 31 | 昭和42年3月号 | うちのとなりは忍者屋敷の巻 | 2 | 3 | 3 | 2 | 5 |
| 32 | 昭和42年4月号 | ハットリ剣法の巻 | 2 | - | 3 | 2 | 5 |
| 33 | 昭和42年5月号 | 続・ハットリ剣法の巻 | 2 | - | 3 | 2 | - |
| 34 | 昭和42年6月号 | 忍者学校の巻（前編） | 2 | 4 | 4 | 2 | 5 |
| 35 | 昭和42年7月号 | 忍者学校の巻（後編） | 2 | 4 | 4 | 2 | - |
| 36 | 昭和42年8月号 | 忍者怪獣ジッポウ上京の巻 | 3 | 5 | 4 | 2 | - |
| 37 | 昭和42年9月号 | ジッポウいそうろう作戦の巻 | 3 | 5 | 4 | 2 | - |
| 38 | 昭和42年10月号 | ジッポウご対面の巻 | 3 | - | 4 | 2 | - |
| 39 | 昭和42年11月号 | 怪獣忍法対機械流の巻（前編） | 3 | 8 | 4 | 2 | 5 |
| 39 | 昭和42年12月号 | 怪獣忍法対機械流の巻（後編） | 3 | 8 | 4 | 2 | 5 |
| 40 | 不明 | アリキンズ対ニンジャーズ大決戦の巻 | 3 | - | 4 | 2 | - |
| 41 | 昭和43年1月号 | モンキー温泉ウキキのキーの巻（前編） | 3 | - | 4 | 2 | 5 |
| 42 | 昭和43年2月号 | モンキー温泉ウキキのキーの巻（後編） | 3 | - | 4 | 2 | 5 |